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管轶团队从穿山甲中发现新冠相关冠状病毒

发布时间:2020-02-20 发布者:亚洲时报

2月18日,预印本网站bioRxiv(未经同行评议)发表论文“中国南方马来穿山甲2019-nCoV相关冠状病毒的鉴定”,通讯作者为香港大学公共卫生学院新发传染病国家重点实验室管轶教授、广西医科大学胡艳玲教授。


 

管轶教授 (图源:新浪网)


在此次这项最新研究中,管轶等人对广西和广东反走私行动中查获的多个穿山甲样本进行了检测,并在穿山甲样本中发现了2019-nCoV相关冠状病毒,属于此次新冠病毒的两个亚型,其中一个受体结合域与新冠病毒密切相关。

 

研究显示,穿山甲体内发现的冠状病毒与新冠病毒全序列相似性为85.5-92.4%,低于蝙蝠RaTG13的96.2%。但穿山甲病毒的受体结合域(RBD)与新冠病毒更相似,达97.4%,5个关键位点完全相同。相比之下,蝙蝠RBD与新冠病毒的相似性只有89.2%,5个位点只有1个相同。

 

研究人员还发现,新冠病毒RBD以外序列与蝙蝠序列更相似,提示存在趋同进化或病毒重组。

 

新型冠状病毒属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属,此前已有一些研究注意到,Sarbecovirus亚属的冠状病毒成员均经历了广泛的基因重组。为了验证上述观点,研究团队进一步进行了重组分析重组,分析显示,蝙蝠冠状病毒ZC45和ZCS21可能是重组体。

 

研究团队推测,广东穿山甲冠状病毒与新冠病毒之间的氨基酸同源性可能是由于选择性介导的趋同进化,而不是重组引起的。当然,根据现有数据仍然很难判断。

 

管轶团队此前在2017年8月至2018年1月期间收集到18只马来穿山甲的冷冻组织(肺、肠、血)样本。这些穿山甲是在广西海关缉私行动中获得。这些样本的RNA高通量测序显示,43个样本中的6个(2个肺,2个肠,1个肺肠混合物,1份血液)存在冠状病毒。

 

研究团队还发现鳞片样品中包含冠状病毒序列,用这些数据组装了一个21505bp的部分基因组序列(标记为GD/P2S),可以代表2019-nCoV基因组的72%。

 

另外,2019年在广东进行的另一项关于患病穿山甲的研究也从肺样本中发现了与2019-nCoV相似的病毒重叠群。通过不同的组装方法和人工筛选,获得了约占全长病毒基因组86.3%的部分基因组序列(标记为GD/P1L)。

 

这些在穿山甲中发现的冠状病毒的基因组,与新型冠状病毒基因组相似率在85.5%-92.4%,并在系统进化树中代表了新冠病毒的两个亚型,其中GD/P1L和GD/P2S与新冠病毒密切相关。

 

研究团队还提到,包括新冠病毒在内的冠状病毒,广泛存在于亚洲的许多野生哺乳动物中。虽然穿山甲冠状病毒的流行病学、致病性、种间传染性和传播性仍有待研究,但此次研究提供的数据强烈表明,处理这些动物需要相当谨慎,应严格禁止在菜市场出售。

 

资料显示,管轶教授现任香港大学微生物学系教授,是最先提出果子狸是SARS冠状病毒主要载体的科学家之一。他还是香港大学新发传染性疾病国家重点实验室主任以及香港大学流感研究中心主任,是当今禽流感病毒国际权威之一。

 

亚洲时报 综合

责任编辑:Carrick

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